Следующая важная миссия, в которой участвовал Мефодий, была направлена к еврейскому народу хазар (860) в Херсонскую область и другие части южной России. Братья должны были найти мощи папы Климента I, который был замучен и похоронен там, и обратить в христианство как можно больше людей.

Чтобы суметь убедить местных жителей, Константин-Кирилл обратился с молитвами к Богу и всего за несколько месяцев выучил древнееврейский язык, читал его книги, затем выучил самаритянский и поразил всех тем, что говорил и читал на их языках. Снова молитвами он успокаивает море и ему удается вынести мощи св. Климента из него. На дорогах через хазарские земли он встречает мадьяр и евреев, останавливает нападение на христианский город и объясняет остальным верующим смысл православия. Он и Мефодий обратили в христианство около 200 человек и оставили память о «таком человеке, который словом и примером объяснил нам, что христианская вера свята» (св. Климент Охридский, «Полное житие Константина Кирилла»).