Мефодий выполнил завещание брата и вскоре после его смерти отправился в Великую Моравию. Там он был назначен папой Адрианом II архиепископом (870 г.) первого славянского епископства в Сирмиуме, завоеванного болгарами еще в 827 г. Но очень скоро он был арестован по приказу баварских епископов и без ведома папы заключен в тюрьму за проповедь христианской веры на славянском языке. Против него был устроен суд в форме собора епископов, причем Людвиг II Немецкий лично председательствовал на процессе.

Когда Мефодий предстает перед своими обвинителями, Людвиг иронично усмехается: «Ты вспотел», а Учитель отвечает словами Сократа: «Это потому, что я спорю с дураками». Через три года Мефодий освобождается новым папой Иоанном VIII и вместе со своими учениками продолжает переводить, писать книги и обучать клириков.